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medsci-skills

作者 Aperivue · Aperivue/medsci-skills

由醫師打造的 23 個 Claude Code 技能，涵蓋完整的醫學研究流程——文獻搜尋、研究方案、統計分析、圖表製作、IMRAD 論文撰寫、審稿回覆。

MedSci Skills 涵蓋端對端的臨床研究工作流程：附驗證引用的文獻搜尋、樣本數計算、去識別化處理、支援 13 種以上研究設計的 Python/R 統計程式碼、PRISMA/STROBE/STARD 合規稽核、期刊發表圖表、完整 IMRAD 論文、審稿回覆框架，以及期刊推薦。內建防止幻覺的引用驗證機制。

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使用場景

實戰用法： medsci-skills

撰寫符合 STROBE 規範的觀察性研究論文

👤 已完成資料清理，準備進入撰寫階段的臨床研究人員 ⏱ ~120 min advanced

何時使用： 分析工作已完成，需要將結果轉化為可投稿的 IMRAD 格式論文。

步驟
  1. 根據分析結果起草方法與結果章節
    Use medsci-skills. Here are my analysis outputs and study design (retrospective cohort). Draft the Methods and Results sections, STROBE-compliant.✓ 已複製
    → 包含 STROBE 條目對應的完整草稿
  2. 執行合規性稽核
    Now audit this manuscript against the STROBE checklist — flag every missing item.✓ 已複製
    → 表格：條目 / 是否符合 / 備註
  3. 以審稿人視角進行自我審查
    Now critique this manuscript as a reviewer at the target journal would. Be harsh.✓ 已複製
    → 附行號參照的逐條批評

結果： 一份通過報告準則稽核、並在投稿前經過壓力測試的論文。

注意事項
  • 引用格式正確但實際上並不存在的文獻 — 本技能強制要求驗證——絕不接受無法在 PubMed 開啟的引用
搭配使用： arxiv · biomcp

執行符合 PRISMA 規範的系統性文獻回顧流程

👤 正在開始進行系統性回顧或統合分析的研究人員 ⏱ ~240 min advanced

何時使用： 開始進行以 PRISMA 為指引的文獻回顧。

步驟
  1. 建立搜尋策略並執行檢索
    Use medsci-skills to design a PRISMA search for '<topic>'. Run it against PubMed and Europe PMC.✓ 已複製
    → 布林搜尋策略及各資料庫的命中數量
  2. 篩選文獻並提取資料
    For the included studies, extract into the meta-analysis pipeline format.✓ 已複製
    → 結構化資料提取表格
  3. 生成 PRISMA 流程圖與森林圖
    Now generate the PRISMA diagram and forest plot figures at journal resolution.✓ 已複製
    → 可直接貼入論文的 PDF/PNG 圖表

結果： 一份符合規範的系統性回顧論文架構，並附帶相關圖表。

注意事項
  • 搜尋範圍過廣導致超過 10,000 筆結果 — 使用本技能的查詢精煉工具縮小搜尋詞彙
搭配使用： arxiv

計算樣本數並生成符合 IRB 要求的說明段落

👤 準備倫理審查申請的主持人（PI） ⏱ ~15 min intermediate

何時使用： IRB 審查前，需要正確完成統計學依據說明時。

步驟
  1. 指定效果量、顯著水準與統計檢定力
    Use medsci-skills sample-size. Design: two-arm RCT. Primary outcome: continuous, expected difference 0.3 SD, alpha 0.05, power 0.8, 1:1 allocation.✓ 已複製
    → 每組所需人數 + 計算公式 + 符合 IRB 要求的說明段落

結果： 一段可直接貼入研究計畫書的統計依據說明。

起草逐點回覆審稿意見的回覆信

👤 正在準備修改稿的作者 ⏱ ~45 min intermediate

何時使用： 收到第一輪（R1）審稿意見，需要有條理地進行回覆時。

步驟
  1. 組織回覆信的結構
    Here are the reviewer comments. Use medsci-skills to draft a point-by-point response — quote comment, response, revised manuscript location.✓ 已複製
    → 附有論文行號參照的結構化表格式回覆

結果： 一封讓編輯讚賞的回覆信。

注意事項
  • 對每條意見都表示同意，反而削弱了論文的論點 — 要求本技能針對你不認同的意見，以佐證資料提出反駁

組合

與其他 MCP 搭配，撬動十倍槓桿

medsci-skill + arxiv + biomcp

從可驗證 ID 的來源抓取原始文獻作為引用

Use biomcp + medsci-skills literature-search to find RCTs on <topic> from 2020–2025.✓ 已複製
medsci-skill + filesystem

將研究計畫書、論文、圖表與統計程式碼統一放在一個有版本控制的資料夾中

Create project structure per medsci-skills conventions and initialize git.✓ 已複製

工具

此 MCP 暴露的能力

工具輸入參數何時呼叫成本
literature-search topic, databases 任何研究任務的起始階段 0
sample-size design, effect size, alpha, power 撰寫研究計畫書時 0
deidentify clinical dataset 任何資料處理工作前 0
stats-code design, data structure 資料分析階段 0
manuscript-imrad outputs, design 論文撰寫階段 0
compliance-audit manuscript, guideline (STROBE/PRISMA/…) 投稿前 0
journal-recommender manuscript 選擇投稿期刊時 0
reviewer-response reviews, manuscript 修改稿準備階段 0

成本與限制

運行它的成本

API 配額
本技能本身不占用任何 API 配額
每次呼叫 Token 數
用量較大——論文草稿約需 10–30k tokens
費用
免費，開放原始碼
提示
先用較小的模型起草，再用 Opus 精修——兩階段方法可節省約一半費用

安全

權限、密鑰、影響範圍

憑證儲存： 不儲存任何憑證；所有資料庫 API 金鑰（PubMed 等）均從環境變數讀取
資料出站： 僅傳送至你自行設定的資料庫——PubMed、arXiv 等。切勿在未去識別化的情況下將受保護的健康資訊（PHI）傳送至外部 LLM。

故障排查

常見錯誤與修復

literature-search returns no results

擴大搜尋詞彙範圍；本技能預設使用嚴格的布林搜尋模式

Compliance audit flags many items as missing

這在初稿中是正常現象——依嚴重程度排序，逐一處理即可

替代方案

medsci-skills 對比其他方案

替代方案何時用它替代權衡
biomcp主要需要生物醫學資料檢索，不需要論文撰寫功能時寫作輔助功能較少
arxiv僅需要預印本文獻時不支援醫學報告準則合規檢查

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資源

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